Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN7AQ01118 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN7AQ01118 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms