Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2BQ00403 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GTF2BQ00403 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2BQ00403 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2BQ00403 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2BQ00403 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2BQ00403 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2BQ00403 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2BQ00403 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2BQ00403 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2BQ00403 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2BQ00403 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2BQ00403 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2BQ00403 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2BQ00403 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2BQ00403 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2BQ00403 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2BQ00403 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2BQ00403 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2BQ00403 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2BQ00403 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms