Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKOR1P84550 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms