Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX4P78413 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX4P78413 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX4P78413 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX4P78413 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX4P78413 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX4P78413 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX4P78413 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX4P78413 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX4P78413 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX4P78413 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX4P78413 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX4P78413 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRX4P78413 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRX4P78413 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRX4P78413 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX4P78413 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX4P78413 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX4P78413 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX4P78413 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX4P78413 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX4P78413 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX4P78413 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX4P78413 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX4P78413 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX4P78413 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX4P78413 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX4P78413 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX4P78413 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX4P78413 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX4P78413 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX4P78413 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX4P78413 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX4P78413 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX4P78413 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX4P78413 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX4P78413 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX4P78413 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX4P78413 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX4P78413 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX4P78413 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX4P78413 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX4P78413 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX4P78413 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX4P78413 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX4P78413 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX4P78413 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX4P78413 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX4P78413 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX4P78413 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX4P78413 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX4P78413 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX4P78413 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX4P78413 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX4P78413 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX4P78413 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX4P78413 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX4P78413 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX4P78413 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX4P78413 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX4P78413 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX4P78413 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX4P78413 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX4P78413 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX4P78413 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX4P78413 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX4P78413 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX4P78413 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX4P78413 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX4P78413 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX4P78413 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX4P78413 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX4P78413 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX4P78413 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX4P78413 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX4P78413 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX4P78413 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX4P78413 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX4P78413 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX4P78413 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX4P78413 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX4P78413 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX4P78413 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX4P78413 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX4P78413 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX4P78413 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX4P78413 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX4P78413 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX4P78413 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX4P78413 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX4P78413 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX4P78413 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX4P78413 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX4P78413 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX4P78413 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX4P78413 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX4P78413 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX4P78413 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX4P78413 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX4P78413 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms