Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITX1P78337 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITX1P78337 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITX1P78337 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PITX1P78337 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITX1P78337 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITX1P78337 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITX1P78337 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITX1P78337 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITX1P78337 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITX1P78337 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITX1P78337 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITX1P78337 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITX1P78337 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PITX1P78337 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITX1P78337 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITX1P78337 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITX1P78337 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITX1P78337 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITX1P78337 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITX1P78337 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITX1P78337 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PITX1P78337 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITX1P78337 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITX1P78337 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITX1P78337 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITX1P78337 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITX1P78337 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITX1P78337 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITX1P78337 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITX1P78337 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITX1P78337 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITX1P78337 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITX1P78337 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITX1P78337 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITX1P78337 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITX1P78337 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITX1P78337 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITX1P78337 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITX1P78337 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITX1P78337 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITX1P78337 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITX1P78337 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITX1P78337 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITX1P78337 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITX1P78337 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITX1P78337 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITX1P78337 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITX1P78337 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITX1P78337 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITX1P78337 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITX1P78337 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PITX1P78337 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PITX1P78337 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PITX1P78337 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PITX1P78337 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PITX1P78337 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PITX1P78337 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PITX1P78337 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PITX1P78337 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PITX1P78337 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PITX1P78337 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITX1P78337 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITX1P78337 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITX1P78337 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITX1P78337 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITX1P78337 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITX1P78337 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITX1P78337 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITX1P78337 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITX1P78337 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITX1P78337 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITX1P78337 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITX1P78337 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITX1P78337 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITX1P78337 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITX1P78337 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITX1P78337 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITX1P78337 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITX1P78337 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITX1P78337 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITX1P78337 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITX1P78337 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITX1P78337 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITX1P78337 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITX1P78337 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITX1P78337 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITX1P78337 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITX1P78337 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITX1P78337 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITX1P78337 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITX1P78337 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PITX1P78337 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITX1P78337 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITX1P78337 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITX1P78337 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITX1P78337 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITX1P78337 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITX1P78337 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITX1P78337 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms