Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBBP68871 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBBP68871 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBBP68871 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBBP68871 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBBP68871 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBBP68871 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBBP68871 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBBP68871 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBBP68871 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBBP68871 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBBP68871 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBBP68871 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBBP68871 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBBP68871 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBBP68871 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBBP68871 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBBP68871 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBBP68871 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBBP68871 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBBP68871 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBBP68871 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBBP68871 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBBP68871 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBBP68871 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBBP68871 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBBP68871 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBBP68871 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HBBP68871 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBBP68871 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBBP68871 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBBP68871 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBBP68871 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBBP68871 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBBP68871 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBBP68871 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBBP68871 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBBP68871 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBBP68871 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBBP68871 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBBP68871 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBBP68871 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBBP68871 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBBP68871 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBBP68871 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBBP68871 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBBP68871 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBBP68871 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBBP68871 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBBP68871 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBBP68871 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBBP68871 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HBBP68871 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBBP68871 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBBP68871 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBBP68871 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HBBP68871 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBBP68871 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBBP68871 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBBP68871 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBBP68871 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBBP68871 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HBBP68871 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBBP68871 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBBP68871 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBBP68871 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBBP68871 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBBP68871 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBBP68871 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBBP68871 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBBP68871 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBBP68871 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBBP68871 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBBP68871 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBBP68871 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBBP68871 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HBBP68871 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HBBP68871 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HBBP68871 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HBBP68871 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HBBP68871 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HBBP68871 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HBBP68871 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HBBP68871 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HBBP68871 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HBBP68871 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HBBP68871 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HBBP68871 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HBBP68871 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HBBP68871 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HBBP68871 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HBBP68871 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HBBP68871 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HBBP68871 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HBBP68871 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HBBP68871 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HBBP68871 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HBBP68871 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HBBP68871 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HBBP68871 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms