Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA9P57773 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA9P57773 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA9P57773 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA9P57773 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA9P57773 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA9P57773 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA9P57773 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA9P57773 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA9P57773 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA9P57773 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA9P57773 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA9P57773 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA9P57773 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA9P57773 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA9P57773 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA9P57773 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA9P57773 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA9P57773 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA9P57773 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA9P57773 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA9P57773 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA9P57773 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA9P57773 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA9P57773 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA9P57773 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA9P57773 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA9P57773 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA9P57773 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA9P57773 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA9P57773 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA9P57773 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA9P57773 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA9P57773 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA9P57773 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA9P57773 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA9P57773 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA9P57773 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA9P57773 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJA9P57773 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJA9P57773 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJA9P57773 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJA9P57773 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA9P57773 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA9P57773 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA9P57773 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA9P57773 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA9P57773 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA9P57773 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA9P57773 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA9P57773 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA9P57773 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA9P57773 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA9P57773 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA9P57773 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA9P57773 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA9P57773 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA9P57773 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA9P57773 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA9P57773 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA9P57773 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA9P57773 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA9P57773 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA9P57773 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA9P57773 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA9P57773 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA9P57773 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA9P57773 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA9P57773 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA9P57773 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA9P57773 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA9P57773 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA9P57773 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA9P57773 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA9P57773 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA9P57773 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA9P57773 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA9P57773 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA9P57773 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA9P57773 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA9P57773 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA9P57773 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA9P57773 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA9P57773 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA9P57773 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA9P57773 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA9P57773 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA9P57773 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA9P57773 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA9P57773 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA9P57773 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA9P57773 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA9P57773 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA9P57773 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA9P57773 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA9P57773 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA9P57773 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA9P57773 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA9P57773 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA9P57773 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms