Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms