Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OXCT1P55809 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms