Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB1P54762 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms