Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATXN1P54253 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms