Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms