Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 SRPK1-208ENST00000507292 634 ntTSL 33.18□□□□□ -1.91e-9■■■■■ 31
HNRNPMP52272 D2HGDH-205ENST00000432449 566 ntTSL 531.26■■■□□ 2.592e-7■■■■■ 31
HNRNPMP52272 D2HGDH-211ENST00000467427 555 ntTSL 331.26■■■□□ 2.592e-7■■■■■ 31
HNRNPMP52272 EHMT1-228ENST00000636027 3114 ntTSL 515.75■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 31
HNRNPMP52272 RABGAP1L-219ENST00000526253 439 ntTSL 513.73□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 31
HNRNPMP52272 ZC3H4-204ENST00000597069 664 ntTSL 420.79■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 31
HNRNPMP52272 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.461e-6■■■■■ 31
HNRNPMP52272 NDUFA10-213ENST00000497536 563 ntTSL 220.85■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 31
HNRNPMP52272 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.733e-8■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.573e-8■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 PPFIA1-222ENST00000532504 5159 ntTSL 1 (best)21.58■■□□□ 1.053e-8■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.73e-7■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.613e-7■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 CDK5RAP2-214ENST00000481266 970 ntTSL 532.97■■■□□ 2.871e-8■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 PLEC-211ENST00000527303 598 ntTSL 335■■■■□ 3.193e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 TRNT1-206ENST00000413000 483 ntTSL 427.76■■■□□ 2.033e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 TMEM123-204ENST00000526676 467 ntTSL 425.25■■□□□ 1.633e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 ZNF695-205ENST00000491337 714 ntTSL 225.11■■□□□ 1.613e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 ZNF695-203ENST00000479214 885 ntTSL 525.11■■□□□ 1.613e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 NSUN2-208ENST00000513888 1290 ntTSL 224.52■■□□□ 1.523e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.53e-6■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.343e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 GFM2-205ENST00000506778 566 ntTSL 422.3■■□□□ 1.163e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 ATAD3B-205ENST00000485748 3233 ntTSL 221.51■■□□□ 1.033e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.033e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 ADCY7-210ENST00000567277 2304 ntTSL 1 (best)21.41■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 ATAD3B-204ENST00000474481 3367 ntTSL 220.66■□□□□ 0.93e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 TRNT1-202ENST00000280591 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.723e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.73e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 SUMF1-204ENST00000448413 3150 ntTSL 219.26■□□□□ 0.673e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.653e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 NSUN2-202ENST00000502932 512 ntTSL 318.66■□□□□ 0.583e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 ZNF670-ZNF695-201ENST00000465049 1042 ntAPPRIS P5 TSL 516.98■□□□□ 0.313e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 GFM2-206ENST00000509097 1004 ntTSL 1 (best)16.38■□□□□ 0.213e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 GFM2-203ENST00000427854 1870 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.173e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 TRNT1-208ENST00000434583 1871 ntTSL 216.03■□□□□ 0.163e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 ZNF695-202ENST00000366504 862 ntTSL 1 (best)15.48■□□□□ 0.073e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 ZNF695-201ENST00000339986 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.033e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 GFM2-201ENST00000296805 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.093e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 ZNF695-206ENST00000498046 504 ntTSL 314.43□□□□□ -0.13e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.183e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.183e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 GFM2-202ENST00000345239 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.223e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 TRNT1-204ENST00000397779 374 ntTSL 513.58□□□□□ -0.243e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.283e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.33e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.353e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.353e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.373e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.433e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 GFM2-207ENST00000509430 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.433e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 ZNF695-204ENST00000487338 826 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.513e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.513e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 ZNF670-ZNF695-202ENST00000474541 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.573e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 NSUN2-209ENST00000514127 614 ntTSL 35.13□□□□□ -1.593e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 TMEM123-207ENST00000531103 568 ntTSL 45.02□□□□□ -1.613e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 TMEM123-206ENST00000529492 549 ntTSL 24.97□□□□□ -1.613e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 TMEM123-203ENST00000525577 550 ntTSL 44.16□□□□□ -1.743e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 TMEM123-205ENST00000528969 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 43.88□□□□□ -1.793e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 TRNT1-211ENST00000482311 447 ntTSL 33.82□□□□□ -1.83e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 DOT1L-204ENST00000457590 2907 ntTSL 521.42■■□□□ 1.023e-7■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 OGT-203ENST00000444774 556 ntTSL 416.62■□□□□ 0.252e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.062e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.132e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 OGT-211ENST00000498566 601 ntTSL 37.79□□□□□ -1.162e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 OGT-210ENST00000488174 7243 ntTSL 57.28□□□□□ -1.242e-9■■■■■ 30.9
HNRNPMP52272 DNAJB6-212ENST00000465908 694 ntTSL 325.29■■□□□ 1.646e-7■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 PRR4-209ENST00000541456 454 ntTSL 34.85□□□□□ -1.632e-7■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 SH2B3-203ENST00000550925 648 ntTSL 531.79■■■□□ 2.683e-7■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.613e-7■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 VPS13B-206ENST00000496144 5625 ntTSL 512.61□□□□□ -0.393e-7■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.193e-7■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.283e-7■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 ARID1B-209ENST00000494260 696 ntTSL 318.09■□□□□ 0.495e-7■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 ARID1B-217ENST00000636607 406 ntTSL 312.13□□□□□ -0.475e-7■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.762e-8■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.757e-7■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.667e-7■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 RBBP5-203ENST00000484379 367 ntTSL 225.4■■□□□ 1.666e-9■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 RBBP5-202ENST00000367164 4290 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.416e-9■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 RBBP5-201ENST00000264515 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.596e-9■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 ISYNA1-204ENST00000577916 2148 ntTSL 533.12■■■□□ 2.892e-6■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 ISYNA1-211ENST00000582811 2039 ntTSL 229.97■■■□□ 2.392e-6■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.362e-6■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.772e-6■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 ISYNA1-210ENST00000582770 1654 ntTSL 226.11■■□□□ 1.772e-6■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 ISYNA1-203ENST00000577820 1466 ntTSL 522.14■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 TMEM248-205ENST00000433271 1610 ntTSL 1 (best)39.96■■■■□ 3.991e-6■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 TMEM248-207ENST00000607045 690 ntTSL 335.27■■■■□ 3.241e-6■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 TMEM248-204ENST00000424964 536 ntTSL 422.99■■□□□ 1.271e-6■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 TMEM248-203ENST00000418375 545 ntTSL 420.72■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 TMEM248-202ENST00000413593 637 ntTSL 415.81■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 30.8
HNRNPMP52272 HNRNPK-206ENST00000457156 1283 ntTSL 528.94■■■□□ 2.224e-8■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.834e-8■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.054e-8■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.568e-8■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 HNRNPK-209ENST00000483135 900 ntTSL 29.81□□□□□ -0.848e-8■■■■■ 30.7
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 220.7 ms