Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUMBP49757 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUMBP49757 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUMBP49757 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUMBP49757 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUMBP49757 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUMBP49757 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUMBP49757 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUMBP49757 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUMBP49757 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUMBP49757 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUMBP49757 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUMBP49757 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUMBP49757 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUMBP49757 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUMBP49757 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUMBP49757 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUMBP49757 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUMBP49757 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUMBP49757 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUMBP49757 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUMBP49757 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUMBP49757 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUMBP49757 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUMBP49757 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUMBP49757 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUMBP49757 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUMBP49757 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUMBP49757 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUMBP49757 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUMBP49757 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUMBP49757 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUMBP49757 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUMBP49757 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUMBP49757 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUMBP49757 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUMBP49757 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUMBP49757 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUMBP49757 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUMBP49757 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUMBP49757 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUMBP49757 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUMBP49757 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUMBP49757 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUMBP49757 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUMBP49757 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUMBP49757 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUMBP49757 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUMBP49757 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUMBP49757 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUMBP49757 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUMBP49757 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUMBP49757 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUMBP49757 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUMBP49757 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUMBP49757 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUMBP49757 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUMBP49757 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUMBP49757 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUMBP49757 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUMBP49757 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUMBP49757 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUMBP49757 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUMBP49757 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUMBP49757 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUMBP49757 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUMBP49757 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUMBP49757 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUMBP49757 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUMBP49757 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUMBP49757 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUMBP49757 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUMBP49757 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUMBP49757 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUMBP49757 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUMBP49757 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUMBP49757 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUMBP49757 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUMBP49757 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUMBP49757 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUMBP49757 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUMBP49757 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUMBP49757 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUMBP49757 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUMBP49757 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUMBP49757 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUMBP49757 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUMBP49757 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUMBP49757 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NUMBP49757 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUMBP49757 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUMBP49757 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUMBP49757 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUMBP49757 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUMBP49757 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUMBP49757 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUMBP49757 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUMBP49757 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUMBP49757 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUMBP49757 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms