Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POU3F4P49335 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms