Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMAN1P49257 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms