Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MARCKSL1P49006 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms