Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TDO2P48775 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDO2P48775 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDO2P48775 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDO2P48775 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDO2P48775 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDO2P48775 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDO2P48775 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDO2P48775 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDO2P48775 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDO2P48775 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDO2P48775 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDO2P48775 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDO2P48775 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDO2P48775 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDO2P48775 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDO2P48775 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDO2P48775 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDO2P48775 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TDO2P48775 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TDO2P48775 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TDO2P48775 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TDO2P48775 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TDO2P48775 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TDO2P48775 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDO2P48775 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDO2P48775 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDO2P48775 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDO2P48775 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDO2P48775 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDO2P48775 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDO2P48775 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDO2P48775 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDO2P48775 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDO2P48775 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TDO2P48775 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TDO2P48775 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TDO2P48775 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TDO2P48775 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TDO2P48775 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TDO2P48775 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TDO2P48775 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TDO2P48775 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TDO2P48775 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TDO2P48775 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TDO2P48775 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TDO2P48775 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TDO2P48775 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDO2P48775 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDO2P48775 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDO2P48775 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDO2P48775 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDO2P48775 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDO2P48775 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDO2P48775 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDO2P48775 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDO2P48775 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDO2P48775 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDO2P48775 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDO2P48775 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDO2P48775 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDO2P48775 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDO2P48775 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDO2P48775 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDO2P48775 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDO2P48775 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDO2P48775 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDO2P48775 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDO2P48775 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDO2P48775 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDO2P48775 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDO2P48775 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDO2P48775 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDO2P48775 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDO2P48775 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TDO2P48775 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TDO2P48775 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TDO2P48775 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TDO2P48775 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TDO2P48775 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TDO2P48775 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TDO2P48775 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TDO2P48775 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TDO2P48775 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TDO2P48775 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDO2P48775 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDO2P48775 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDO2P48775 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDO2P48775 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDO2P48775 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TDO2P48775 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDO2P48775 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDO2P48775 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDO2P48775 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDO2P48775 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TDO2P48775 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TDO2P48775 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TDO2P48775 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDO2P48775 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDO2P48775 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms