Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RXRGP48443 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RXRGP48443 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RXRGP48443 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RXRGP48443 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RXRGP48443 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RXRGP48443 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RXRGP48443 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RXRGP48443 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RXRGP48443 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RXRGP48443 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RXRGP48443 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RXRGP48443 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RXRGP48443 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RXRGP48443 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RXRGP48443 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RXRGP48443 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RXRGP48443 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RXRGP48443 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RXRGP48443 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RXRGP48443 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RXRGP48443 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RXRGP48443 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RXRGP48443 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RXRGP48443 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RXRGP48443 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RXRGP48443 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RXRGP48443 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RXRGP48443 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RXRGP48443 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RXRGP48443 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RXRGP48443 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RXRGP48443 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RXRGP48443 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RXRGP48443 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RXRGP48443 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RXRGP48443 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RXRGP48443 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RXRGP48443 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RXRGP48443 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RXRGP48443 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RXRGP48443 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RXRGP48443 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RXRGP48443 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RXRGP48443 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RXRGP48443 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RXRGP48443 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RXRGP48443 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RXRGP48443 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RXRGP48443 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RXRGP48443 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RXRGP48443 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RXRGP48443 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RXRGP48443 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RXRGP48443 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RXRGP48443 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RXRGP48443 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RXRGP48443 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RXRGP48443 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RXRGP48443 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RXRGP48443 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RXRGP48443 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RXRGP48443 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RXRGP48443 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RXRGP48443 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RXRGP48443 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RXRGP48443 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RXRGP48443 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RXRGP48443 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RXRGP48443 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RXRGP48443 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RXRGP48443 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RXRGP48443 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RXRGP48443 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RXRGP48443 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RXRGP48443 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RXRGP48443 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RXRGP48443 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RXRGP48443 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RXRGP48443 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RXRGP48443 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RXRGP48443 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RXRGP48443 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RXRGP48443 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RXRGP48443 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RXRGP48443 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RXRGP48443 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RXRGP48443 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RXRGP48443 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RXRGP48443 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RXRGP48443 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RXRGP48443 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RXRGP48443 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RXRGP48443 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RXRGP48443 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RXRGP48443 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RXRGP48443 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RXRGP48443 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RXRGP48443 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RXRGP48443 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms