Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms