Protein–RNA interactions for Protein: P46776

RPL27A, 60S ribosomal protein L27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27AP46776 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL27AP46776 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL27AP46776 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL27AP46776 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL27AP46776 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL27AP46776 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL27AP46776 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL27AP46776 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL27AP46776 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL27AP46776 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL27AP46776 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.5 ms