Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms