Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPHP41219 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPHP41219 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPHP41219 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPHP41219 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPHP41219 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPHP41219 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPHP41219 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPHP41219 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPHP41219 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPHP41219 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPHP41219 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPHP41219 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPHP41219 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPHP41219 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPHP41219 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPHP41219 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRPHP41219 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPHP41219 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPHP41219 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPHP41219 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPHP41219 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPHP41219 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPHP41219 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPHP41219 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPHP41219 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPHP41219 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPHP41219 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPHP41219 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPHP41219 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPHP41219 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPHP41219 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPHP41219 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPHP41219 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPHP41219 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPHP41219 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPHP41219 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPHP41219 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPHP41219 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPHP41219 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPHP41219 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPHP41219 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPHP41219 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPHP41219 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPHP41219 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPHP41219 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPHP41219 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPHP41219 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPHP41219 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPHP41219 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPHP41219 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPHP41219 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPHP41219 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPHP41219 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPHP41219 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPHP41219 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPHP41219 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPHP41219 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPHP41219 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPHP41219 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPHP41219 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPHP41219 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPHP41219 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPHP41219 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPHP41219 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPHP41219 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPHP41219 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPHP41219 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPHP41219 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPHP41219 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPHP41219 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPHP41219 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPHP41219 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPHP41219 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPHP41219 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPHP41219 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPHP41219 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPHP41219 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPHP41219 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPHP41219 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPHP41219 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPHP41219 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPHP41219 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRPHP41219 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPHP41219 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPHP41219 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPHP41219 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPHP41219 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPHP41219 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPHP41219 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPHP41219 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPHP41219 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPHP41219 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPHP41219 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPHP41219 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPHP41219 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPHP41219 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPHP41219 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPHP41219 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPHP41219 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms