Protein–RNA interactions for Protein: P36100

TFA1, Transcription initiation factor IIE subunit alpha, yeastyeast

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFA1P36100 LIN1YHR156C 1023 nt10.12□□□□□ -0.79
TFA1P36100 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt10.12□□□□□ -0.79
TFA1P36100 MRP51YPL118W 1035 nt10.12□□□□□ -0.79
TFA1P36100 SMF1YOL122C 1728 nt10.12□□□□□ -0.79
TFA1P36100 MET7YOR241W 1647 nt10.11□□□□□ -0.79
TFA1P36100 ENO1YGR254W 1314 nt10.11□□□□□ -0.79
TFA1P36100 TIF3YPR163C 1311 nt10.11□□□□□ -0.79
TFA1P36100 TMS1YDR105C 1422 nt10.11□□□□□ -0.79
TFA1P36100 CLB1YGR108W 1416 nt10.11□□□□□ -0.79
TFA1P36100 RUB1YDR139C 234 nt10.11□□□□□ -0.79
TFA1P36100 YGL109WYGL109W 324 nt10.11□□□□□ -0.79
TFA1P36100 SRB5YGR104C 924 nt10.11□□□□□ -0.79
TFA1P36100 BUD19YJL188C 309 nt10.11□□□□□ -0.79
TFA1P36100 COX17YLL009C 210 nt10.11□□□□□ -0.79
TFA1P36100 ECM13YBL043W 774 nt10.11□□□□□ -0.79
TFA1P36100 YPL261CYPL261C 309 nt10.11□□□□□ -0.79
TFA1P36100 YPR172WYPR172W 603 nt10.11□□□□□ -0.79
TFA1P36100 PEX31YGR004W 1389 nt10.11□□□□□ -0.79
TFA1P36100 MPP10YJR002W 1782 nt10.11□□□□□ -0.79
TFA1P36100 VNX1YNL321W 2727 nt10.11□□□□□ -0.79
TFA1P36100 HED1YDR014W-A 489 nt10.1□□□□□ -0.79
TFA1P36100 STE18YJR086W 333 nt10.1□□□□□ -0.79
TFA1P36100 SFC1YJR095W 969 nt10.1□□□□□ -0.79
TFA1P36100 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt10.1□□□□□ -0.79
TFA1P36100 YLR334CYLR334C 381 nt10.1□□□□□ -0.79
TFA1P36100 YNR061CYNR061C 660 nt10.1□□□□□ -0.79
TFA1P36100 TUM1YOR251C 915 nt10.1□□□□□ -0.79
TFA1P36100 TKL2YBR117C 2046 nt10.1□□□□□ -0.79
TFA1P36100 SPC97YHR172W 2472 nt10.1□□□□□ -0.79
TFA1P36100 STR2YJR130C 1920 nt10.09□□□□□ -0.79
TFA1P36100 SEO1YAL067C 1782 nt10.09□□□□□ -0.79
TFA1P36100 INO1YJL153C 1602 nt10.09□□□□□ -0.79
TFA1P36100 RPL12AYEL054C 498 nt10.09□□□□□ -0.79
TFA1P36100 BET4YJL031C 984 nt10.09□□□□□ -0.79
TFA1P36100 CYC3YAL039C 810 nt10.09□□□□□ -0.79
TFA1P36100 DCN1YLR128W 810 nt10.09□□□□□ -0.79
TFA1P36100 ERD2YBL040C 660 nt10.09□□□□□ -0.79
TFA1P36100 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt10.09□□□□□ -0.79
TFA1P36100 ATP19YOL077W-A 207 nt10.09□□□□□ -0.79
TFA1P36100 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt10.09□□□□□ -0.79
TFA1P36100 POP7YBR167C 423 nt10.09□□□□□ -0.79
TFA1P36100 WSC3YOL105C 1671 nt10.09□□□□□ -0.79
TFA1P36100 SYS1YJL004C 612 nt10.08□□□□□ -0.8
TFA1P36100 RPL10YLR075W 666 nt10.08□□□□□ -0.8
TFA1P36100 TSA1YML028W 591 nt10.08□□□□□ -0.8
TFA1P36100 POL31YJR006W 1464 nt10.08□□□□□ -0.8
TFA1P36100 ERG9YHR190W 1335 nt10.07□□□□□ -0.8
TFA1P36100 APM2YHL019C 1818 nt10.07□□□□□ -0.8
TFA1P36100 YDR387CYDR387C 1668 nt10.07□□□□□ -0.8
TFA1P36100 PGD1YGL025C 1194 nt10.07□□□□□ -0.8
TFA1P36100 BET1YIL004C 429 nt10.07□□□□□ -0.8
TFA1P36100 YLR444CYLR444C 303 nt10.07□□□□□ -0.8
TFA1P36100 GGA1YDR358W 1674 nt10.06□□□□□ -0.8
TFA1P36100 GLE2YER107C 1098 nt10.06□□□□□ -0.8
TFA1P36100 LNP1YHR192W 837 nt10.06□□□□□ -0.8
TFA1P36100 YJL043WYJL043W 774 nt10.06□□□□□ -0.8
TFA1P36100 RSM7YJR113C 744 nt10.06□□□□□ -0.8
TFA1P36100 DGA1YOR245C 1257 nt10.06□□□□□ -0.8
TFA1P36100 MSA1YOR066W 1890 nt10.06□□□□□ -0.8
TFA1P36100 SIS2YKR072C 1689 nt10.06□□□□□ -0.8
TFA1P36100 NPL4YBR170C 1743 nt10.05□□□□□ -0.8
TFA1P36100 PMT7YDR307W 1989 nt10.05□□□□□ -0.8
TFA1P36100 RPL35BYDL136W 363 nt10.05□□□□□ -0.8
TFA1P36100 MST27YGL051W 705 nt10.05□□□□□ -0.8
TFA1P36100 YIL082WYIL082W 873 nt10.05□□□□□ -0.8
TFA1P36100 MST28YAR033W 705 nt10.05□□□□□ -0.8
TFA1P36100 SEN15YMR059W 387 nt10.05□□□□□ -0.8
TFA1P36100 PET123YOR158W 957 nt10.05□□□□□ -0.8
TFA1P36100 PEX3YDR329C 1326 nt10.05□□□□□ -0.8
TFA1P36100 SLU7YDR088C 1149 nt10.04□□□□□ -0.8
TFA1P36100 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt10.04□□□□□ -0.8
TFA1P36100 YIR035CYIR035C 765 nt10.04□□□□□ -0.8
TFA1P36100 CUE5YOR042W 1236 nt10.04□□□□□ -0.8
TFA1P36100 KTR1YOR099W 1182 nt10.04□□□□□ -0.8
TFA1P36100 YOR105WYOR105W 327 nt10.04□□□□□ -0.8
TFA1P36100 CMR3YPR013C 954 nt10.04□□□□□ -0.8
TFA1P36100 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt10.04□□□□□ -0.8
TFA1P36100 MPH2YDL247W 1830 nt10.04□□□□□ -0.8
TFA1P36100 ILV1YER086W 1731 nt10.04□□□□□ -0.8
TFA1P36100 GRX3YDR098C 858 nt10.03□□□□□ -0.8
TFA1P36100 YGR042WYGR042W 816 nt10.03□□□□□ -0.8
TFA1P36100 YIL025CYIL025C 375 nt10.03□□□□□ -0.8
TFA1P36100 MNN11YJL183W 1269 nt10.03□□□□□ -0.8
TFA1P36100 RCL1YOL010W 1104 nt10.03□□□□□ -0.8
TFA1P36100 VPS21YOR089C 633 nt10.03□□□□□ -0.8
TFA1P36100 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt10.03□□□□□ -0.8
TFA1P36100 YGL176CYGL176C 1665 nt10.02□□□□□ -0.8
TFA1P36100 TRE2YOR256C 2430 nt10.02□□□□□ -0.81
TFA1P36100 UPF3YGR072W 1164 nt10.02□□□□□ -0.81
TFA1P36100 YIL163CYIL163C 354 nt10.02□□□□□ -0.81
TFA1P36100 YJR141WYJR141W 1044 nt10.02□□□□□ -0.81
TFA1P36100 DUS4YLR405W 1104 nt10.02□□□□□ -0.81
TFA1P36100 ARF3YOR094W 552 nt10.02□□□□□ -0.81
TFA1P36100 PDX3YBR035C 687 nt10.02□□□□□ -0.81
TFA1P36100 BMT2YBR141C 1014 nt10.02□□□□□ -0.81
TFA1P36100 HEM1YDR232W 1647 nt10.02□□□□□ -0.81
TFA1P36100 HRP1YOL123W 1605 nt10.02□□□□□ -0.81
TFA1P36100 NFS1YCL017C 1494 nt10.02□□□□□ -0.81
TFA1P36100 FOB1YDR110W 1701 nt10.02□□□□□ -0.81
TFA1P36100 YME1YPR024W 2244 nt10.01□□□□□ -0.81
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