Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF2H1P32780 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms