Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CLIP1P30622 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms