Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
HTR1EP28566 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTR1EP28566 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms