Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPA1P27694 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPA1P27694 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPA1P27694 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPA1P27694 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPA1P27694 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPA1P27694 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPA1P27694 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPA1P27694 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPA1P27694 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPA1P27694 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPA1P27694 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPA1P27694 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPA1P27694 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPA1P27694 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPA1P27694 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPA1P27694 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPA1P27694 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPA1P27694 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPA1P27694 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPA1P27694 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPA1P27694 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPA1P27694 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPA1P27694 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPA1P27694 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPA1P27694 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPA1P27694 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPA1P27694 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPA1P27694 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPA1P27694 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RPA1P27694 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPA1P27694 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPA1P27694 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPA1P27694 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPA1P27694 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPA1P27694 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPA1P27694 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPA1P27694 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPA1P27694 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPA1P27694 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPA1P27694 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPA1P27694 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPA1P27694 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPA1P27694 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPA1P27694 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPA1P27694 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPA1P27694 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPA1P27694 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPA1P27694 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPA1P27694 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPA1P27694 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPA1P27694 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPA1P27694 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPA1P27694 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPA1P27694 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPA1P27694 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPA1P27694 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPA1P27694 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPA1P27694 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPA1P27694 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPA1P27694 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPA1P27694 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPA1P27694 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPA1P27694 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPA1P27694 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPA1P27694 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPA1P27694 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPA1P27694 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPA1P27694 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPA1P27694 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPA1P27694 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPA1P27694 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPA1P27694 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPA1P27694 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPA1P27694 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPA1P27694 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPA1P27694 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPA1P27694 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPA1P27694 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RPA1P27694 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPA1P27694 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPA1P27694 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPA1P27694 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPA1P27694 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPA1P27694 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPA1P27694 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPA1P27694 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPA1P27694 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPA1P27694 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPA1P27694 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPA1P27694 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPA1P27694 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RPA1P27694 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPA1P27694 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPA1P27694 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPA1P27694 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA1P27694 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA1P27694 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA1P27694 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA1P27694 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms