Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRDP23468 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
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