Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM21P19474 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM21P19474 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms