Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2CP19387 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms