Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GM2AP17900 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GM2AP17900 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GM2AP17900 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GM2AP17900 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GM2AP17900 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GM2AP17900 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GM2AP17900 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GM2AP17900 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GM2AP17900 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GM2AP17900 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GM2AP17900 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GM2AP17900 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GM2AP17900 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GM2AP17900 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GM2AP17900 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GM2AP17900 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GM2AP17900 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GM2AP17900 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GM2AP17900 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GM2AP17900 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GM2AP17900 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GM2AP17900 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GM2AP17900 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GM2AP17900 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GM2AP17900 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GM2AP17900 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GM2AP17900 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GM2AP17900 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GM2AP17900 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GM2AP17900 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GM2AP17900 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GM2AP17900 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GM2AP17900 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GM2AP17900 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GM2AP17900 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GM2AP17900 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GM2AP17900 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GM2AP17900 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GM2AP17900 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GM2AP17900 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GM2AP17900 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GM2AP17900 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GM2AP17900 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GM2AP17900 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GM2AP17900 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GM2AP17900 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GM2AP17900 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GM2AP17900 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GM2AP17900 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GM2AP17900 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GM2AP17900 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GM2AP17900 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GM2AP17900 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GM2AP17900 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GM2AP17900 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GM2AP17900 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GM2AP17900 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GM2AP17900 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GM2AP17900 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GM2AP17900 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GM2AP17900 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GM2AP17900 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GM2AP17900 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GM2AP17900 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GM2AP17900 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GM2AP17900 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GM2AP17900 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GM2AP17900 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GM2AP17900 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GM2AP17900 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GM2AP17900 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GM2AP17900 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GM2AP17900 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GM2AP17900 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GM2AP17900 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GM2AP17900 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GM2AP17900 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GM2AP17900 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GM2AP17900 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GM2AP17900 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GM2AP17900 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GM2AP17900 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GM2AP17900 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GM2AP17900 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GM2AP17900 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GM2AP17900 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GM2AP17900 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GM2AP17900 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GM2AP17900 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GM2AP17900 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GM2AP17900 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GM2AP17900 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GM2AP17900 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GM2AP17900 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GM2AP17900 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GM2AP17900 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GM2AP17900 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GM2AP17900 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GM2AP17900 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms