Protein–RNA interactions for Protein: P16109

SELP, P-selectin, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELPP16109 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SELPP16109 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SELPP16109 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SELPP16109 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SELPP16109 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SELPP16109 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SELPP16109 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SELPP16109 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SELPP16109 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SELPP16109 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SELPP16109 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SELPP16109 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SELPP16109 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SELPP16109 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SELPP16109 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELPP16109 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELPP16109 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELPP16109 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SELPP16109 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELPP16109 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELPP16109 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELPP16109 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELPP16109 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELPP16109 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELPP16109 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SELPP16109 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SELPP16109 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SELPP16109 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SELPP16109 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SELPP16109 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SELPP16109 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SELPP16109 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SELPP16109 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SELPP16109 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SELPP16109 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SELPP16109 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SELPP16109 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SELPP16109 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SELPP16109 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELPP16109 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELPP16109 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELPP16109 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELPP16109 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELPP16109 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELPP16109 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELPP16109 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELPP16109 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELPP16109 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELPP16109 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELPP16109 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELPP16109 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELPP16109 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELPP16109 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SELPP16109 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELPP16109 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SELPP16109 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELPP16109 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELPP16109 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SELPP16109 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELPP16109 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELPP16109 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SELPP16109 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELPP16109 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SELPP16109 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELPP16109 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELPP16109 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELPP16109 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELPP16109 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELPP16109 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SELPP16109 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SELPP16109 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SELPP16109 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SELPP16109 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SELPP16109 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SELPP16109 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SELPP16109 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SELPP16109 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SELPP16109 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SELPP16109 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SELPP16109 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SELPP16109 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SELPP16109 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SELPP16109 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SELPP16109 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SELPP16109 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SELPP16109 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SELPP16109 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SELPP16109 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SELPP16109 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SELPP16109 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SELPP16109 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SELPP16109 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SELPP16109 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SELPP16109 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SELPP16109 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SELPP16109 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SELPP16109 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SELPP16109 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SELPP16109 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SELPP16109 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms