Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LYL1P12980 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LYL1P12980 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LYL1P12980 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LYL1P12980 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LYL1P12980 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LYL1P12980 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LYL1P12980 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LYL1P12980 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LYL1P12980 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LYL1P12980 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LYL1P12980 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LYL1P12980 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LYL1P12980 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LYL1P12980 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LYL1P12980 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LYL1P12980 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LYL1P12980 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LYL1P12980 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LYL1P12980 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LYL1P12980 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LYL1P12980 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LYL1P12980 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LYL1P12980 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LYL1P12980 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LYL1P12980 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LYL1P12980 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LYL1P12980 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LYL1P12980 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LYL1P12980 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LYL1P12980 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LYL1P12980 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LYL1P12980 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LYL1P12980 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LYL1P12980 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LYL1P12980 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LYL1P12980 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LYL1P12980 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LYL1P12980 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LYL1P12980 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LYL1P12980 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LYL1P12980 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LYL1P12980 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LYL1P12980 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LYL1P12980 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LYL1P12980 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LYL1P12980 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LYL1P12980 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LYL1P12980 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LYL1P12980 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LYL1P12980 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LYL1P12980 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LYL1P12980 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LYL1P12980 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LYL1P12980 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LYL1P12980 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LYL1P12980 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LYL1P12980 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LYL1P12980 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LYL1P12980 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LYL1P12980 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LYL1P12980 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LYL1P12980 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LYL1P12980 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LYL1P12980 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LYL1P12980 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LYL1P12980 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LYL1P12980 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LYL1P12980 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LYL1P12980 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LYL1P12980 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LYL1P12980 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LYL1P12980 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LYL1P12980 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LYL1P12980 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LYL1P12980 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LYL1P12980 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LYL1P12980 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LYL1P12980 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LYL1P12980 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LYL1P12980 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LYL1P12980 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LYL1P12980 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LYL1P12980 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LYL1P12980 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LYL1P12980 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LYL1P12980 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LYL1P12980 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYL1P12980 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYL1P12980 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYL1P12980 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYL1P12980 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYL1P12980 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYL1P12980 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYL1P12980 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYL1P12980 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LYL1P12980 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LYL1P12980 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYL1P12980 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYL1P12980 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms