Protein–RNA interactions for Protein: P11217

PYGM, Glycogen phosphorylase, muscle form, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGMP11217 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PYGMP11217 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PYGMP11217 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PYGMP11217 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PYGMP11217 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PYGMP11217 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PYGMP11217 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PYGMP11217 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYGMP11217 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYGMP11217 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYGMP11217 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYGMP11217 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PYGMP11217 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYGMP11217 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYGMP11217 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYGMP11217 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYGMP11217 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYGMP11217 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYGMP11217 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYGMP11217 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYGMP11217 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYGMP11217 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYGMP11217 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYGMP11217 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYGMP11217 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYGMP11217 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYGMP11217 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYGMP11217 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYGMP11217 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYGMP11217 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PYGMP11217 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYGMP11217 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYGMP11217 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYGMP11217 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGMP11217 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGMP11217 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGMP11217 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGMP11217 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGMP11217 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGMP11217 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGMP11217 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGMP11217 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGMP11217 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGMP11217 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGMP11217 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGMP11217 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGMP11217 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGMP11217 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGMP11217 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGMP11217 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGMP11217 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGMP11217 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGMP11217 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGMP11217 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGMP11217 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGMP11217 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGMP11217 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGMP11217 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGMP11217 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PYGMP11217 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PYGMP11217 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PYGMP11217 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PYGMP11217 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PYGMP11217 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PYGMP11217 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PYGMP11217 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PYGMP11217 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PYGMP11217 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PYGMP11217 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PYGMP11217 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PYGMP11217 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PYGMP11217 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PYGMP11217 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PYGMP11217 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PYGMP11217 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PYGMP11217 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PYGMP11217 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PYGMP11217 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PYGMP11217 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PYGMP11217 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PYGMP11217 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PYGMP11217 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PYGMP11217 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PYGMP11217 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PYGMP11217 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYGMP11217 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYGMP11217 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYGMP11217 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYGMP11217 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYGMP11217 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYGMP11217 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PYGMP11217 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYGMP11217 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYGMP11217 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYGMP11217 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYGMP11217 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYGMP11217 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYGMP11217 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYGMP11217 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYGMP11217 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms