Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFTA3P0C7M3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms