Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC175P0C221 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms