Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACAA1P09110 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA1P09110 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA1P09110 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms