Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms