Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A1P05023 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms