Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-33P01772 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms