Protein–RNA interactions for Protein: P01133

EGF, Pro-epidermal growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFP01133 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFP01133 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFP01133 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFP01133 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFP01133 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFP01133 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFP01133 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFP01133 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFP01133 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFP01133 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFP01133 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFP01133 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFP01133 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFP01133 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFP01133 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFP01133 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFP01133 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFP01133 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFP01133 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFP01133 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFP01133 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFP01133 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFP01133 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFP01133 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFP01133 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFP01133 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFP01133 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFP01133 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFP01133 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EGFP01133 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EGFP01133 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EGFP01133 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EGFP01133 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EGFP01133 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EGFP01133 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EGFP01133 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EGFP01133 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFP01133 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFP01133 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFP01133 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFP01133 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFP01133 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFP01133 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFP01133 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFP01133 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFP01133 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFP01133 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFP01133 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFP01133 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFP01133 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFP01133 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFP01133 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFP01133 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFP01133 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFP01133 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFP01133 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFP01133 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFP01133 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFP01133 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFP01133 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFP01133 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFP01133 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFP01133 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFP01133 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFP01133 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFP01133 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFP01133 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGFP01133 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGFP01133 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGFP01133 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGFP01133 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGFP01133 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGFP01133 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EGFP01133 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGFP01133 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGFP01133 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGFP01133 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGFP01133 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFP01133 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFP01133 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFP01133 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFP01133 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFP01133 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFP01133 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFP01133 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFP01133 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFP01133 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFP01133 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EGFP01133 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EGFP01133 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EGFP01133 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EGFP01133 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EGFP01133 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFP01133 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFP01133 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFP01133 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFP01133 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFP01133 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFP01133 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFP01133 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms