Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX11BO96011 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms