Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC2O95409 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms