Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE8BO95263 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE8BO95263 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms