Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALDH1A2O94788 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms