Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SURF6O75683 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SURF6O75683 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SURF6O75683 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SURF6O75683 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SURF6O75683 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SURF6O75683 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SURF6O75683 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SURF6O75683 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SURF6O75683 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SURF6O75683 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SURF6O75683 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SURF6O75683 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SURF6O75683 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SURF6O75683 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SURF6O75683 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SURF6O75683 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SURF6O75683 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SURF6O75683 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SURF6O75683 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SURF6O75683 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SURF6O75683 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SURF6O75683 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SURF6O75683 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SURF6O75683 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SURF6O75683 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SURF6O75683 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SURF6O75683 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SURF6O75683 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SURF6O75683 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SURF6O75683 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SURF6O75683 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SURF6O75683 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SURF6O75683 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SURF6O75683 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SURF6O75683 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SURF6O75683 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SURF6O75683 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SURF6O75683 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SURF6O75683 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SURF6O75683 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SURF6O75683 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SURF6O75683 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SURF6O75683 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SURF6O75683 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SURF6O75683 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SURF6O75683 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SURF6O75683 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SURF6O75683 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SURF6O75683 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SURF6O75683 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SURF6O75683 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SURF6O75683 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SURF6O75683 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SURF6O75683 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SURF6O75683 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SURF6O75683 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SURF6O75683 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SURF6O75683 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SURF6O75683 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SURF6O75683 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SURF6O75683 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SURF6O75683 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SURF6O75683 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SURF6O75683 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SURF6O75683 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SURF6O75683 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SURF6O75683 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SURF6O75683 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SURF6O75683 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SURF6O75683 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SURF6O75683 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SURF6O75683 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SURF6O75683 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SURF6O75683 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SURF6O75683 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SURF6O75683 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SURF6O75683 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SURF6O75683 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SURF6O75683 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SURF6O75683 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SURF6O75683 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SURF6O75683 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SURF6O75683 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SURF6O75683 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SURF6O75683 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SURF6O75683 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SURF6O75683 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SURF6O75683 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SURF6O75683 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SURF6O75683 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SURF6O75683 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SURF6O75683 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SURF6O75683 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SURF6O75683 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SURF6O75683 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SURF6O75683 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SURF6O75683 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SURF6O75683 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SURF6O75683 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms