Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PITX3O75364 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PITX3O75364 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX3O75364 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX3O75364 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX3O75364 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX3O75364 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX3O75364 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX3O75364 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX3O75364 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX3O75364 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX3O75364 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX3O75364 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX3O75364 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX3O75364 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX3O75364 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX3O75364 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX3O75364 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX3O75364 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX3O75364 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX3O75364 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX3O75364 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX3O75364 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX3O75364 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX3O75364 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX3O75364 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX3O75364 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX3O75364 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX3O75364 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX3O75364 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX3O75364 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX3O75364 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX3O75364 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX3O75364 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX3O75364 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX3O75364 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX3O75364 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX3O75364 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX3O75364 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX3O75364 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX3O75364 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX3O75364 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX3O75364 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX3O75364 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX3O75364 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX3O75364 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX3O75364 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX3O75364 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX3O75364 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX3O75364 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX3O75364 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX3O75364 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX3O75364 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX3O75364 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX3O75364 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX3O75364 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX3O75364 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX3O75364 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX3O75364 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX3O75364 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX3O75364 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX3O75364 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX3O75364 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX3O75364 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX3O75364 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX3O75364 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX3O75364 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX3O75364 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX3O75364 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX3O75364 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX3O75364 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX3O75364 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX3O75364 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX3O75364 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX3O75364 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX3O75364 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX3O75364 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX3O75364 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX3O75364 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX3O75364 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX3O75364 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX3O75364 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX3O75364 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX3O75364 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX3O75364 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX3O75364 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX3O75364 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX3O75364 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX3O75364 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX3O75364 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX3O75364 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX3O75364 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX3O75364 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX3O75364 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX3O75364 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX3O75364 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PITX3O75364 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PITX3O75364 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX3O75364 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX3O75364 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms