Protein–RNA interactions for Protein: O75112

LDB3, LIM domain-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB3O75112 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDB3O75112 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDB3O75112 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDB3O75112 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDB3O75112 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDB3O75112 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDB3O75112 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDB3O75112 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDB3O75112 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDB3O75112 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDB3O75112 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDB3O75112 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDB3O75112 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDB3O75112 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDB3O75112 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDB3O75112 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDB3O75112 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDB3O75112 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDB3O75112 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDB3O75112 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDB3O75112 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDB3O75112 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDB3O75112 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDB3O75112 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDB3O75112 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDB3O75112 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDB3O75112 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDB3O75112 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDB3O75112 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDB3O75112 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDB3O75112 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDB3O75112 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LDB3O75112 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LDB3O75112 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LDB3O75112 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LDB3O75112 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDB3O75112 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDB3O75112 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LDB3O75112 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDB3O75112 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LDB3O75112 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LDB3O75112 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LDB3O75112 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDB3O75112 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDB3O75112 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LDB3O75112 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LDB3O75112 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDB3O75112 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDB3O75112 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDB3O75112 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LDB3O75112 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LDB3O75112 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LDB3O75112 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LDB3O75112 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LDB3O75112 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LDB3O75112 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LDB3O75112 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDB3O75112 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDB3O75112 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LDB3O75112 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDB3O75112 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDB3O75112 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDB3O75112 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDB3O75112 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDB3O75112 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDB3O75112 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LDB3O75112 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDB3O75112 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDB3O75112 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LDB3O75112 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LDB3O75112 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LDB3O75112 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDB3O75112 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDB3O75112 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDB3O75112 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDB3O75112 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LDB3O75112 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDB3O75112 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LDB3O75112 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDB3O75112 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LDB3O75112 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LDB3O75112 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LDB3O75112 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LDB3O75112 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDB3O75112 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDB3O75112 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDB3O75112 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDB3O75112 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LDB3O75112 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDB3O75112 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LDB3O75112 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LDB3O75112 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDB3O75112 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDB3O75112 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LDB3O75112 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDB3O75112 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDB3O75112 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LDB3O75112 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LDB3O75112 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LDB3O75112 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms