Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSVO60911 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSVO60911 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSVO60911 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSVO60911 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSVO60911 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSVO60911 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSVO60911 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CTSVO60911 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CTSVO60911 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSVO60911 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSVO60911 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSVO60911 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSVO60911 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSVO60911 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSVO60911 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSVO60911 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSVO60911 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSVO60911 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSVO60911 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSVO60911 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSVO60911 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSVO60911 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSVO60911 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSVO60911 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSVO60911 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSVO60911 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSVO60911 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSVO60911 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSVO60911 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSVO60911 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSVO60911 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSVO60911 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSVO60911 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSVO60911 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSVO60911 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSVO60911 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSVO60911 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSVO60911 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSVO60911 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSVO60911 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSVO60911 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSVO60911 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSVO60911 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSVO60911 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTSVO60911 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTSVO60911 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTSVO60911 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTSVO60911 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTSVO60911 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTSVO60911 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTSVO60911 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTSVO60911 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTSVO60911 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTSVO60911 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CTSVO60911 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CTSVO60911 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTSVO60911 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTSVO60911 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTSVO60911 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTSVO60911 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTSVO60911 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTSVO60911 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTSVO60911 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTSVO60911 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTSVO60911 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTSVO60911 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTSVO60911 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTSVO60911 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTSVO60911 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTSVO60911 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTSVO60911 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTSVO60911 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTSVO60911 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTSVO60911 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTSVO60911 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTSVO60911 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTSVO60911 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTSVO60911 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTSVO60911 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTSVO60911 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTSVO60911 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTSVO60911 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTSVO60911 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTSVO60911 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTSVO60911 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSVO60911 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSVO60911 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSVO60911 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSVO60911 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSVO60911 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSVO60911 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSVO60911 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSVO60911 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSVO60911 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSVO60911 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSVO60911 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSVO60911 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSVO60911 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSVO60911 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms